Τα προβλήματα ξεκίνησαν όταν ο Swartz αγόρασε ένα laptop τον Σεπτέμβριο του 2010 και έτρεξε έναν παράνομο κώδικα για να κατεβάσει όσο το δυνατόν περισσότερα άρθρα από τη βιβλιοθήκη JSTOR (τεράστιος κατάλογος επιστημονικών περιοδικών, άρθρων, papers κλπ.), φυσικά με ψεύτικο όνομα.
Όταν το JSTOR ανακάλυψε το script, μπλόκαρε τη συγκεκριμένη IP και ο Swartz αγόρασε δεύτερο laptop για να κάνει την ίδια διαδικασία. Για ακόμα μία φορά ανακαλύφθηκε το script και το JSTOR αναγκάστηκε να μπλοκάρει όλες τις διευθύνσεις IP του MIT campus.
Μετά από λίγες εβδομάδες, άρθηκε το μπλοκάρισμα των IPs, αλλά ο Swartz κατηγορήθηκε ότι έστησε ένα ολόκληρο δίκτυο σε μια ντουλάπα συντήρησης του MIT με κρυμμένο υπολογιστή και σκληρούς δίσκους ώστε να συνεχίσει να κατεβάζει παράνομα χιλιάδες άρθρα.
Η προτεινόμενη ποινή του εισαγγελέα ήταν 35 χρόνια (!) κάθειρξη για υποκλοπή πληροφορίων και καταστροφή προστατευόμενου υπολογιστή, παρά το γεγονός ότι το JSTOR είχε αποσύρει ήδη την αγωγή εναντίον του και μάλιστα στήριξε τον Aaron στον δικαστικό αγώνα!
Προς το παρόν, κανείς δεν μπορεί να μιλήσει με βεβαιότητα για τους λόγους που οδήγησαν τον Swartz στην αυτοκτονία, αλλά οι γονείς του κατηγορούν ευθέως τόσο το σύστημα δικαιοσύνης και τους εισαγγελείς, όσο και το MIT που δεν στάθηκε στο πλευρό του νεαρού. Ό,τι και να έγινε, το αποτέλεσμα παραμένει το ίδιο τραγικό…